Bioinformatik
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Wie werden der Code und die Daten während der Analyse versioniert?
asked 2017-05-18 14:27:51 UTC
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Zuordnungen von Probeset zu Probeset zwischen Affymetrix-Arrays
asked 2017-05-18 17:52:23 UTC
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Wie kann ich Strukturvarianten (SVs) aus Pair-End-Short-Read-Resequenzierungsdaten aufrufen?
asked 2017-05-18 19:28:48 UTC
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Wie filtere ich Kreuzausrichtungen aus einer BED-Datei heraus?
asked 2017-05-19 10:49:47 UTC
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Führen Sie Hunderte kleiner BAM-Dateien zu einer einzigen BAM-Datei zusammen
asked 2017-05-19 10:50:24 UTC
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Wie kann man zwischen dem "klassischen" de Bruijn-Graphen und dem in NGS-Papieren beschriebenen unterscheiden?
asked 2017-05-19 15:32:45 UTC
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Sind fgsea und Broad Institute GSEA gleichwertig?
asked 2017-05-19 17:32:54 UTC
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Warum benötigen einige Assembler für die Erstellung von de Bruijn-Graphen einen ungeraden Kmer?
asked 2017-05-19 23:34:21 UTC
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Werden Soft-Clipped-Basen für Variantenaufrufe in samtools + bcftools verwendet?
asked 2017-05-19 23:50:05 UTC
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Phyre2 vs ITasser, ganz andere Modelle generiert
asked 2017-05-19 23:59:49 UTC
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Wie unterscheiden sich die Algorithmen für enge und breite Spitzen von MACS2?
asked 2017-05-20 05:21:09 UTC
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Wie bewerte ich bei einem VCF eines menschlichen Genoms die Qualität anhand bekannter SNVs?
asked 2017-05-21 02:49:51 UTC
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Wie gehe ich mit Heterozygotie beim Polieren der Genomassemblierung auf der Grundlage langer Lesevorgänge um?
asked 2017-05-21 16:49:59 UTC
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Erwartete Allelhäufigkeitsverteilung von SNVs in realen NGS-Daten
asked 2017-05-22 15:47:44 UTC
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Der Zustand, Einschränkungen und Vergleiche von großen Variantengeschäften
asked 2017-05-22 21:14:17 UTC
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Entwerfen eines Labor-NGS-Dateidatenbankschemas
asked 2017-05-22 21:32:41 UTC
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Tools zur Simulation von Oxford Nanopore-Lesevorgängen
asked 2017-05-22 23:19:53 UTC
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Großbuchstaben gegen Kleinbuchstaben im Referenzgenom
asked 2017-05-24 08:26:50 UTC
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Die Auswirkungen einer unvollständigen Bisulfitumwandlung auf die Kartierungseffizienz
asked 2017-05-24 11:41:10 UTC
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Was sind die Vor- und Nachteile zwischen der Verwendung von KEGG oder Reactome?
asked 2017-05-24 12:35:31 UTC
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Klassifizierung von Proben basierend auf der Markergenexpression
asked 2017-05-24 20:41:28 UTC
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Wie kann ich eine lang gelesene Baugruppe mit einem sich wiederholenden Genom verbessern?
asked 2017-05-25 16:46:36 UTC
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Was ist der Unterschied zwischen den Zelltypen ENCODE Tier 1, 2 und 3?
asked 2017-05-25 23:21:50 UTC
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Variante, die Daten im ChIP-seq-Stil aufruft: samtools mpileup mit minimalen Filtern
asked 2017-05-26 18:23:01 UTC
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Wie wählt man die repräsentativsten Wege aus einer Genanreicherungsanalyse aus?
asked 2017-05-26 19:07:00 UTC
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Gibt es eine einfache Möglichkeit, eine Zusammenfassung einer VCF-Datei (v4.1) mit strukturellen Variationen zu erstellen?
asked 2017-05-29 02:40:14 UTC
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Wie kann der Zelllinienbeitrag aus RNASeq-Daten geschätzt werden?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
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Quantifizierung der Lesezuordnung zu mehreren Loci
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
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Gibt es einen öffentlich verfügbaren Multi-Omics-Datensatz?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Neuzuordnung von Genomkoordinaten zur Berücksichtigung von Indels
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Haben Sie DNA-Motive von 6-12 bp Länge und versuchen Sie, Erhaltungswerte zu erhalten
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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Ist es möglich, die MinION-Sequenzierung offline durchzuführen?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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Wie kann ich die Ausbeute an MinION-Sequenzierungsläufen verbessern?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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Wie kann ich unbekannte Barcode- / Adaptersequenzen innerhalb einer Reihe von Proben systematisch erkennen?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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Welche Tools können chimäre RNA (Fusionsgene) aus WGS- oder RNA-Seq-Daten nachweisen?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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Wie übertrage ich gff-Annotationen im Genom mit umfangreichen Duplikaten?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Arbeiten mit alten Genom-Builds
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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Gibt es einen Punkt bei der Neukalibrierung von Scores für Variantenaufrufe?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Herunterladen eines Referenzgenoms für Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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Stabile Download-URLs
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Strukturvariante, die PacBio-Daten mit geringer Abdeckung erfordert
asked 2017-06-01 04:46:41 UTC
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Imputieren fehlender Genotypen aus separaten Genotypisierungspanels
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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Gibt es RepBase-Alternativen für genomweite Annotationen von Wiederholungselementen?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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Was ist der Unterschied zwischen den VCF-Spezifikationsversionen 4.1 und 4.2?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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Wie wähle ich hochwertige Strukturen aus der Proteindatenbank aus?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Schätzung der Tumorreinheit / Kontamination / Beimischung
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Verwenden Sie andere Muscheln als Bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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Was ist der schnellste Weg, um die Anzahl unbekannter Nukleotide in FASTA / FASTQ-Dateien zu berechnen?
asked 2017-06-01 21:47:03 UTC
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Wie genau wird die in FPKM verwendete "effektive Länge" berechnet?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Fehlende Gene und Normalisierung der RSEM-Ausgabe mit EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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