Bioinformatik
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Gibt es einen öffentlich verfügbaren Multi-Omics-Datensatz?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Neuzuordnung von Genomkoordinaten zur Berücksichtigung von Indels
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Haben Sie DNA-Motive von 6-12 bp Länge und versuchen Sie, Erhaltungswerte zu erhalten
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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Ist es möglich, die MinION-Sequenzierung offline durchzuführen?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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Wie kann ich die Ausbeute an MinION-Sequenzierungsläufen verbessern?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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Wie kann ich unbekannte Barcode- / Adaptersequenzen innerhalb einer Reihe von Proben systematisch erkennen?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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Welche Tools können chimäre RNA (Fusionsgene) aus WGS- oder RNA-Seq-Daten nachweisen?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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Wie übertrage ich gff-Annotationen im Genom mit umfangreichen Duplikaten?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Arbeiten mit alten Genom-Builds
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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Gibt es einen Punkt bei der Neukalibrierung von Scores für Variantenaufrufe?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Herunterladen eines Referenzgenoms für Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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Stabile Download-URLs
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Strukturvariante, die PacBio-Daten mit geringer Abdeckung erfordert
asked 2017-06-01 04:46:41 UTC
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Imputieren fehlender Genotypen aus separaten Genotypisierungspanels
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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Gibt es RepBase-Alternativen für genomweite Annotationen von Wiederholungselementen?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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Was ist der Unterschied zwischen den VCF-Spezifikationsversionen 4.1 und 4.2?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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Wie wähle ich hochwertige Strukturen aus der Proteindatenbank aus?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Schätzung der Tumorreinheit / Kontamination / Beimischung
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Verwenden Sie andere Muscheln als Bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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Was ist der schnellste Weg, um die Anzahl unbekannter Nukleotide in FASTA / FASTQ-Dateien zu berechnen?
asked 2017-06-01 21:47:03 UTC
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Wie genau wird die in FPKM verwendete "effektive Länge" berechnet?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Fehlende Gene und Normalisierung der RSEM-Ausgabe mit EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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Finden des Ortes und der Längeneinheit von sich wiederholenden Sequenzen innerhalb eines langen Lesevorgangs
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
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Generische HMM-Löser in der Bioinformatik?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
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Gibt es Datenbanken mit Vorlagen für gängige bioinformatische Dateiformate?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
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Validierung identifizierter Subpopulationen von Zellen in scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
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Was sind alle Referenzdateien, die vom bwa-Index erstellt wurden, und hängen diese davon ab, ob die Referenz komprimiert ist?
asked 2017-06-03 00:36:08 UTC
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Warum haben BAM-Dateien, die mit verschiedenen Tools erstellt wurden, unterschiedliche Dateigrößen?
asked 2017-06-03 04:38:14 UTC
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Wie kann ich eine BAM-Datei herunterrechnen, während beide Lesevorgänge paarweise bleiben?
asked 2017-06-03 04:44:45 UTC
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Was ist der Unterschied zwischen Samtools, Bamtools, Picard, Sambamba und Biobambam?
asked 2017-06-03 04:50:11 UTC
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Warum geben die meisten Aligner die CIGAR-Operation "X" nicht aus?
asked 2017-06-03 04:58:11 UTC
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Zusammenführen von Sequenzierungsdaten für ChIP-seq-Experimente
asked 2017-06-03 17:42:58 UTC
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Warum ist bwa-mem der Standardalgorithmus bei der Verwendung von bwa?
asked 2017-06-03 18:58:27 UTC
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Was ist der Unterschied zwischen NGS, 2GS, SBS und HTS?
asked 2017-06-04 01:57:33 UTC
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Was ist der Unterschied zwischen der SAM-Mapping-Qualität und dem Blast-E-Wert?
asked 2017-06-04 04:01:34 UTC
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Strukturvarianten mit MinION-Daten erkennen
asked 2017-06-04 18:21:05 UTC
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Welche Methoden gibt es, um die Ähnlichkeit des RNA-Expressionsprofils zu berechnen?
asked 2017-06-04 18:50:24 UTC
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Wie kann ich das Aufrufen / Korrigieren von INDEL für BAM-Dateien beschleunigen?
asked 2017-06-05 04:25:12 UTC
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Wie kann ich eine sehr große zeilenbasierte Datei effizient unterteilen?
asked 2017-06-05 17:49:25 UTC
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R-Pakete zur Datenanalyse gepoolter CRISPR-Bildschirme
asked 2017-06-05 21:36:55 UTC
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Wann sind die Genomregionen auf der schwarzen Liste in ChIP-seq-Datenanalysen zu berücksichtigen?
asked 2017-06-05 22:15:40 UTC
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Wie vergleiche ich Gruppen mit WGS-Daten?
asked 2017-06-05 23:06:35 UTC
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Wie führe ich einen Abstammungs- / Beimischungstest für eine einzelne VCF-Datei durch?
asked 2017-06-06 17:44:58 UTC
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Konvertieren von Gennamen von einem öffentlichen Datenbankformat in ein anderes
asked 2017-06-06 18:38:20 UTC
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Wie werden die Optionen snakemake --cluster und --drama implementiert?
asked 2017-06-06 19:30:00 UTC
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Welche bewährten Methoden sollten bei der Analyse von EPIC-DNA-Methylierungsdaten beachtet werden?
asked 2017-06-07 01:58:15 UTC
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Abrufen eindeutig zugeordneter Lesevorgänge aus der BWA-Mem-Ausrichtung
asked 2017-06-07 03:23:31 UTC
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Was ist die Skalierung für HOMER-Metagene?
asked 2017-06-07 08:39:26 UTC
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Aufbau des STAR-Genomindex für die Nanoporen-RNA-Sequenzierung
asked 2017-06-07 09:20:05 UTC
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Wie kann HISAT2 / StringTie dezimale Abdeckungswerte melden?
asked 2017-06-07 11:21:24 UTC
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